Préchauffer le four à 190 °C (th. 6) et préparer un plat à gratin de 22 × 30 cm.
Porter à ébullition une grande casserole d’eau salée.
Ajouter 450 g de coquillettes et cuire al dente selon les indications du paquet, puis égoutter et réserver.
Dans une casserole à feu moyen, faire fondre 115 g de beurre doux.
Ajouter 60 g de farine de blé (T45 ou T55) et fouetter constamment pendant 1 à 2 minutes pour obtenir un roux.
Verser progressivement 1 L de lait entier, en fouettant pour éviter les grumeaux et obtenir une sauce homogène.
Poursuivre la cuisson en remuant fréquemment jusqu’à ce que la sauce épaississe et nappe la cuillère (environ 5 à 7 minutes).
Hors du feu, incorporer 450 g de cheddar fort râpé et 225 g d’emmental râpé jusqu’à ce que le fromage soit complètement fondu.
Assaisonner la sauce au fromage avec 1 cuillère à café de sel, ½ cuillère à café de poivre noir et une pincée de muscade moulue.
Ajouter les coquillettes égouttées à la sauce au fromage et mélanger délicatement pour bien enrober les pâtes.
Transférer le mélange dans le plat à gratin préparé.
Si vous le souhaitez, répartir 50 g de chapelure sur le dessus.
Enfourner pendant 25 à 30 minutes, jusqu’à ce que le gratin soit bouillonnant sur les bords et bien doré sur le dessus.
Laisser reposer 5 à 10 minutes hors du four avant de servir.